航空
日本的航空业相当发达。日本主要的航空公司有日本航空公司（JAL）、日本全日空航空公司（ANA）、日本航空系统公司（JAS）。这些公司都有与欧洲、亚洲和美洲等各主要城市的庞大的航线网络。另外，世界各国的主要航空公司也有飞往日本各主要城市的飞机航班。如东京－汉城、东京－洛杉矶、东京－纽约、东京－里约热内卢、东京－温哥华、东京－法兰克福、东京－伦敦、东京－马德里、东京－巴黎、东京－罗马、东京－维也纳、东京－曼谷、东京－北京、东京－香港、东京－悉尼等。

铁路
日本的铁路交通网由纵横全国的国营铁路、大中城市之间的私营铁路和城市内的地铁构成。去日本各地旅游可乘国营铁路，在大城市生活可乘私营铁路和地铁，十分方便。 现在，日本全国铁路运行线路达22000公里。从1987年4月开始，国营铁路开始民营化。 

新干线
新干线被人们称为“理想的超级特快”，运行时速为210公里，从1964年10月开始在东京至大阪之间行驶。30多年来，新干线从未发生过一起乘客伤亡事故，被称为世界上最安全的铁路交通工具。
目前的新干线包括4条线路， 即东京至大阪东海道线，全长552.6公里；新大阪至博多线，全长623.9公里；东京至盛冈线，全长535.3公里；大宫至新泻线， 全长303.6公里。从开通到现在， 新干线行驶的路程大约相当于绕地球约4万圈，每年乘客人数超过25亿人次。 各条线路上设有站站停的特快和仅停大站的超特快。从1987年开始，新干线的行驶车辆全面更换， 时速从210公里提高到250公里。

私营铁路与地铁
私营铁路主要连接大城市与近郊市镇，全国长达4700公里，是市民广泛使用的交通工具。
地铁在战前仅东京、大阪有，现在又增加了名古屋、横滨、神户、京都、札幌、福冈等城市，运行线路长达417公里。尤其是1927年开始运行的东京地铁， 每天载客700万人次，线路总长199公里，仅次于纽约、伦敦、巴黎，居世界第4位。

公路网
随着社会的“汽车化”，对公路的依赖程度不断加大。1945年，日本的公路铺修率仅1.2%， 目前已超过65％。特别是高速公路的建设速度惊人，北自青森、南至鹿儿岛之间的高速公路已经贯通。